2025 год. События «Мастерфорс» канули в лету. Отряды автоботов, возглавляемые мощным трансформером Истребителем, охраняют Землю от Смертоносца и его десептиконов.
Смертоносец жаждет вычерпать энергетические ресурсы планеты, возродить гигантскую огневую станцию «Космическая крепость» и покорить Вселенную. Для этого его верные подчинённые – Львиноморд, Задавала, Брестфорсы, Боевые динозавры и прочие десептиконы – ищут энергию в различных населённых пунктах.
Несмотря на героическое сопротивление автоботов, войско Смертоносца добирается до легендарной Атлантиды, богатой различными ресурсами, заново строит «Космическую крепость» и обрушивает на голубую планету метеоритную бомбардировку. Казалось бы, всё пропало, но секрет энергоснабжения вражеской станции неожиданно раскрывает Микон – мальчишка, выросший в полку автоботов…