2207 год. Два года минуло с момента исчезновения планет Гамилас и Искандар. Внезапно в Солнечной системе возникает загадочный гигантский объект – Гранд Реверс. Несмотря на героическое сопротивление Земных сил обороны, Гранд Реверс пробивает многослойный защитный периметр, и новая столица в мгновение ока оказывается под контролем вражеских десантников. В этой ситуации экипаж космического линкора «Ямато» получает секретный приказ и отправляется в плавание в неизведанное пространство и время, ставя на карту судьбу всего человечества...